La presidenta regional, Esperanza Aguirre, ha anunciado que el próximo curso 2012-13 ya estarán en funcionamiento en varios institutos las nuevas Aulas de Excelencia de Bachillerato que, a semejanza del actual Bachillerato de Excelencia que se imparte en el Instituto San Mateo, tendrán un mayor nivel de exigencia con los alumnos que lo soliciten.
Durante la entrega de los Premios de Investigación Julián Marías y Miguel Catalán 2011, Aguirre ha recordado que "no hay mejor recompensa ni mayor estímulo para los estudiantes que saber que está en su mano recibir una educación que les haga esforzarse, superarse y dar lo mejor se sí mismos". La Comunidad mantendrá los Premios de Bachillerato, las Becas de Excelencia, los Premios Extraordinarios de Secundaria, la Mención Honorífica y los Diplomas de Aprovechamiento para reconocer el esfuerzo de los alumnos.